Ciri amat ketara pertanian Jepun adalah kekurangan tanah ladang. 49,000 kilometer persegi (19,000 bt2) di bawah penanaman mendiri hanya 13.2 % dari jumlah kawasan tanah pada 1988. Meskipun, tanah adalah secara intensif ditanam. Sawah padi menduduki kebanyakn dari kawasan desa, sama ada di dataran alluvial, kecerunan teres, atau tanah basah dan teluk pantai. tanah ladang bukan sawah padi mengongsi teres dan kecerunan lebih rendah dan ditanam dengan gandum dan barli sewaktu musim gugur dan dengna kentang manis, sayur-sayuran, dan beras kering pada musim panas. Perantaraan hasil tanaman adalah umum: seperti hasil tanaman yang disilih ganti dengan kacang dan kacang pis.

Pertanian Jepun telah dicirikan sebagai sektor "sakit" kerana ia harus menghadapi pelbagai kekangan, seperti terdapatnya semakin berkurang tanah suai tani dan kepada 14 % pada pertengahan ke lewat 1980an. Masalah beras lebihan telah dijadikan lebih buruk dengan perubahan luas dalam makanan asasi banyak orang Jepun pada 1970an dan 1980an. Walaupun suatu kegagalan hasil tanaman beras tidak mengurangkan bekalan dikumpul dengan lebih daripada 25% dari simpanan. Pada 1990, Jepun adalah 67% self-sufficient dalam produk pertanian dan memperuntukkan doi sekitar 30% dari keperluan bijirin dan makanan.